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遺傳病篩選
- 遺傳病篩選
  發(fā)布時(shí)間：2013-12-11
  遺傳病攜帶者篩查采用液相捕獲技術(shù)和Illumina HiSeq測序技術(shù)，一次性對(duì)人體13大系統(tǒng)的百種常見單基因遺傳病進(jìn)行檢測。只需您的血液樣本或口腔黏膜細(xì)胞即可檢測您的遺傳病致病基因攜帶情況。幫您全面了解自身的健康狀況，將最健康的基因傳遞給后代；預(yù)知患病風(fēng)險(xiǎn)，及時(shí)采取干預(yù)措施，有效規(guī)避潛藏在身體里的每一顆“基因地雷”，為您及家人的健康保駕護(hù)航。
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腫瘤個(gè)性化
- 腫瘤個(gè)性化
  發(fā)布時(shí)間：2016-11-01
  高通量測序（NGS）技術(shù)在腫瘤基因檢測方面有什么優(yōu)勢？隨著人類基因組計(jì)劃的實(shí)施，新一代高通量測序技術(shù)被迅速催生。該技術(shù)擁有優(yōu)良的測序品質(zhì)，能夠高精準(zhǔn)度檢測出基因細(xì)微變化，又擁有上一代測序等基因檢測手段所不具備的絕對(duì)優(yōu)勢：能夠一次性檢測幾乎所有腫瘤相關(guān)基因，并識(shí)別所有形式的基因變異，包括基因拷貝數(shù)變異、結(jié)構(gòu)畸變、點(diǎn)突變等。2009年以來，已經(jīng)有大量科研成果顯示了高通量測序技術(shù)在基因檢測方面的可靠性和高效性。2010年，一項(xiàng)針對(duì)卵巢透明細(xì)胞癌（Ovarian Clear Carcinoma，OCCC）的研究發(fā)表在國際頂級(jí)學(xué)術(shù)雜志《Science》上，他們將通過基因捕獲技術(shù)獲得的8個(gè)OCCC患者的腫瘤樣本DNA進(jìn)行高通量測序，結(jié)果一次性檢測出253個(gè)基因的268種體細(xì)胞突變,平均每種腫瘤的突變基因數(shù)為13至125個(gè)不等,其中除了研究較為普遍的PIK3CA及KRAS與OCCC有關(guān)外，還發(fā)現(xiàn)PPP2R1A功能類似癌基因，ARID1A為腫瘤抑制基因。另外一項(xiàng)研究針對(duì)48位年齡在23-76歲之間的卵巢上皮癌（Epithelial ovarian cancer）患者的腫瘤組織內(nèi)182個(gè)腫瘤相關(guān)基因的高通量測序發(fā)現(xiàn)，不同時(shí)期患者腫瘤組織的基因均發(fā)生了類型各異的基因變異，平均每個(gè)腫瘤組織存在3個(gè)基因突變；同時(shí)篩選出了卵巢上皮癌組織中突變頻率最大的幾個(gè)腫瘤易感基因：TP53（79%），MYC（25%），BRCA1/2（23%），KRAS（16.6%）和NF1（14.5%）。另外，對(duì)單核細(xì)胞白血病、葡萄膜黑素瘤、漿液性子宮內(nèi)膜癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤及前列腺癌等的研究也讓我們看到，高通量測序在檢測腫瘤基因突變中具有其它檢測手段無可匹敵的優(yōu)勢。
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產(chǎn)前診斷
- 產(chǎn)前診斷
  發(fā)布時(shí)間：2013-12-11
  什么是產(chǎn)前診斷?核型分析是產(chǎn)前診斷的金標(biāo)準(zhǔn)，核型分析包括三種有創(chuàng)性的取樣方式：絨毛膜取樣、羊水穿刺和經(jīng)腹臍靜脈穿刺。絨毛膜取樣的最佳孕周為10-14周，羊水穿刺最佳孕周為16-21周，臍帶血穿刺最佳孕周為20-28周，這三種方法都屬于侵入性診斷方法，容易引起感染和流產(chǎn)，且細(xì)胞培養(yǎng)周期較長，并存在培養(yǎng)失敗的可能。什么是無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測？無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測是針對(duì)胎兒染色體數(shù)目異常疾病的新型檢測技術(shù)，目前發(fā)病率較高的21-三體綜合征（唐氏綜合征）、18-三體綜合征（愛德華氏綜合征）和13-三體綜合征（帕陶氏綜合征）都在其檢測范圍內(nèi)。該方法采用新一代高通量測序技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)分析方法，對(duì)孕婦外周血中的胎兒游離DNA進(jìn)行檢測和分析，是一項(xiàng)安全、精確、快速的新型檢測技術(shù)。為什么抽取孕媽媽的血液就可以檢測胎兒染色體疾??？1997年，香港中文大學(xué)盧煜明教授證實(shí)了孕婦外周血中存在胎兒游離DNA, 通過對(duì)孕母外周血中胎兒游離DNA進(jìn)行測序及生物信息分析，最終可實(shí)現(xiàn)對(duì)胎兒的三體患病風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行評(píng)估。無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測可以檢測所有染色體的非整倍性異常嗎？21、18、13-三體綜合征是最常見的胎兒染色體非整倍性疾病，因此無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測的檢測范圍只包括21、18、13-三體綜合征，其它染色體的非整倍性異常不在該檢測范圍內(nèi)。
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轉(zhuǎn)錄調(diào)控
- 全長轉(zhuǎn)錄組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-11-08
  二代測序無法準(zhǔn)確獲得基因完整的5’UTR區(qū)和3’UTR區(qū)。基于PacBio三代測序讀長長的優(yōu)勢，mRNA序列無需打斷即可測通，獲得全長轉(zhuǎn)錄本，提供精確的可變剪接和轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)信息，準(zhǔn)確分辨同源異構(gòu)體，同源基因，家族基因和等位基因，為下游分子克隆實(shí)驗(yàn)提供極佳序列文庫。對(duì)于特異種質(zhì)資源，可以發(fā)現(xiàn)鑒定新基因。
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- 真核轉(zhuǎn)錄組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。一般如不特殊說明，轉(zhuǎn)錄組測序指的是狹義轉(zhuǎn)錄組測序。轉(zhuǎn)錄組成為研究基因表達(dá)的主要手段，轉(zhuǎn)錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的必然紐帶，轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是目前研究最多的，也是生物體最重要的調(diào)控方式。
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- 原核轉(zhuǎn)錄組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  原核轉(zhuǎn)錄組測序是基于HiSeq平臺(tái)，構(gòu)建鏈特異性文庫，研究原核生物在某個(gè)時(shí)期或者在某種環(huán)境條件下轉(zhuǎn)錄出來的所有mRNA。由于原核生物mRNA沒有polyA尾結(jié)構(gòu)，需要采用去除rRNA的方法構(gòu)建文庫，針對(duì)不同的研究物種采取有效的方法去除rRNA，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量。
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- Small RNA測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  Small RNA是生命活動(dòng)重要的調(diào)控因子，短小的序列長度（如microRNA一般在18-30nt之間）;種類繁多， siRNA（小干擾RNA ）， microRNA（微小RNA），還有其他一些種類的小RNA，如piRNA（蛋白互作小RNA），snRNA（小核RNA），snoRNA（核仁小RNA）等種類；幾乎存在于所有的生物體中；在基因表達(dá)調(diào)控、生物個(gè)體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等過程中發(fā)揮著重要作用。
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- LncRNA測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  lncRNA（long noncoding RNA）是一類長度超過200nt的長鏈非編碼RNA，通過與DNA、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合，在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等水平調(diào)控基因表達(dá)。lncRNA測序是研究已有參考基因組物種的特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定時(shí)期轉(zhuǎn)錄出的所有LncRNA和mRNA。
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- circRNA測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  環(huán)狀RNA（circRNA）是區(qū)別于傳統(tǒng)線性RNA的一類新型RNA，具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)，大量存在于真核轉(zhuǎn)錄組中。在不同的物種中具有保守性，同時(shí)存在組織及不同發(fā)育階段的表達(dá)特異性。circRNA通過海綿效應(yīng)，競爭性的吸附和結(jié)合miRNA，從而抑制miRNA功能的行使；通過與RNA結(jié)合蛋白(RBP)結(jié)合，形成復(fù)合物，對(duì)RNA的轉(zhuǎn)錄過程進(jìn)行調(diào)控；通過內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)（IRES）序列，與核糖體結(jié)合，環(huán)狀會(huì)開環(huán)呈線性，然后重新發(fā)揮翻譯蛋白質(zhì)的功能。
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- 降解組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  降解組測序（Degradome Sequencing）主要針對(duì)miRNA介導(dǎo)的剪切降解片段進(jìn)行深度測序，從實(shí)驗(yàn)中篩選miRNA作用的靶基因，并結(jié)合生物信息學(xué)分析優(yōu)勢，確定降解片段與miRNA精確的配對(duì)信息。該技術(shù)能從細(xì)胞或組織中準(zhǔn)確高效地篩選出miRNA的靶基因，為研究miRNA與其對(duì)應(yīng)的靶基因的相互關(guān)系提供準(zhǔn)確、高效的篩選手段。
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- 宏轉(zhuǎn)錄組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門在整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時(shí)期群體生物全基因組轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。宏轉(zhuǎn)錄組測序可原位研究特定生境特定時(shí)空下微生物群落中活躍菌種的組成以及活性基因的表達(dá)情況。結(jié)合理化因素的檢測，宏轉(zhuǎn)錄組可研究多樣本間由于理化等指標(biāo)的差異，時(shí)空上不同微生物群落間活躍成分組成的差異分析。
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- 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single cell RNA sequencing）是在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA和lincRNA進(jìn)行高通量測序的一項(xiàng)新技術(shù)，針對(duì)單個(gè)細(xì)胞研究其整體水平的基因表達(dá)情況，成功解決細(xì)胞分子機(jī)制研究中常見的細(xì)胞異質(zhì)性、細(xì)胞量少而無法進(jìn)行常規(guī)高通量測序等難題。
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- 比較轉(zhuǎn)錄組與泛轉(zhuǎn)錄組
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  比較轉(zhuǎn)錄組測序是基于Illumina HiSeq測序平臺(tái)，通過RNA-seq技術(shù)手段研究物種進(jìn)化，通過不同物種或亞種間mRNA序列差異進(jìn)而分析近源物種間的親緣關(guān)系，挖掘明顯受到正向選擇或負(fù)向選擇的基因。泛轉(zhuǎn)錄組測序不僅能分析比較轉(zhuǎn)錄組的內(nèi)容，同時(shí)還可以構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，挖掘關(guān)鍵基因模塊。
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微生物測序
- 宏基因組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  宏基因組測序是以特定環(huán)境中的整個(gè)微生物群落作為研究對(duì)象，只需要提取環(huán)境微生物總DNA進(jìn)行研究。采用HiSeq或者M(jìn)iSeq測序儀進(jìn)行高通量測序，它擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術(shù)限制，采用新一代高通量測序技術(shù)對(duì)環(huán)境微生物樣品的DNA直接測序。
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- 微生物重測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  微生物基因組的重測序，是基于小片段文庫的高通量測序數(shù)據(jù)，與近緣參考基因組進(jìn)行比對(duì)，進(jìn)行變異檢測的方法。檢測獲得菌株和參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息，以精準(zhǔn)快捷為特點(diǎn)，系統(tǒng)全面的檢測變異信息。同時(shí)還可進(jìn)一步進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。
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- 細(xì)菌基因組de novo
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  隨著細(xì)菌基因組研究的迅速發(fā)展，全基因組測序已逐步成為微生物基礎(chǔ)研究的重要手段之一。新一代高通量測序技術(shù)大大減少了基因組測序的成本和時(shí)間，讓更多實(shí)驗(yàn)室可以開展微生物基因組測序項(xiàng)目。
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- 真菌基因組de novo
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  真菌屬于較低等的真核生物，種類繁多，在自然界中分布廣泛。據(jù)估計(jì)，全世界約有150萬種真菌，其中包含許多具有重要的藥用價(jià)值和食用價(jià)值的有益真菌，同時(shí)也存在著大量能引發(fā)動(dòng)植物病害的致病菌。因此，合理利用有益真菌，控制和預(yù)防有害真菌對(duì)人類的生產(chǎn)和生活具有重要的意義。而真菌基因組的闡明，將為真菌特性的分析提供有用的依據(jù)。隨著第二代高通量測序技術(shù)的成熟，基因組測序成本已大大降低，使得快速而經(jīng)濟(jì)的進(jìn)行真菌基因組測序成為可能，目前真菌基因組學(xué)研究已經(jīng)進(jìn)入了一個(gè)快速增長時(shí)期。
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- 16S 18S ITS等擴(kuò)增子測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  16S/18S/ITS等擴(kuò)增子測序是通過提取環(huán)境樣品的DNA，選擇合適的通用引物擴(kuò)增16S/18S/ITS的目標(biāo)區(qū)域，通過檢測目標(biāo)區(qū)域的序列變異和豐度，以研究環(huán)境微生物多樣性及群落組成差異。ITS分為兩個(gè)區(qū)域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間，ITS2位于5.8S和28S之間。16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
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動(dòng)植物基因組
- 泛基因組測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  泛基因組包括核心基因組 (Core genome) 和非必須基因組 (Dispensable genome)。其中，核心基因組由所有樣本中都存在的序列組成，一般與物種生物學(xué)功能和主要表型特征相關(guān)，反映了物種的穩(wěn)定性；非必須基因組由僅在單個(gè)樣本或部分樣本中存在的序列組成，一般與樣本對(duì)特定環(huán)境的適應(yīng)性或特有的生物學(xué)特征相關(guān)，反映了樣本的特性。
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- 全基因組de nove測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  De novo 測序也叫基因組從頭測序，不需要任何基因序列信息即可對(duì)某個(gè)物種進(jìn)行測序。通過對(duì)基因組序列未知或沒有近源物種基因組信息的某個(gè)物種，對(duì)其不同長度基因組DNA片段及其文庫進(jìn)行序列測定，用生物信息學(xué)的分析方法對(duì)序列進(jìn)行拼接、組裝，從而獲得該物種的基因組序列圖譜。目前廣泛應(yīng)用于從頭解析未知物種的基因組序列、基因組成、進(jìn)化特點(diǎn)等。
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- 全基因組survey
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  基因組調(diào)研圖研究是對(duì)于沒有基因組參考序列的物種，基于小片段文庫的低深度測序數(shù)據(jù)，可以有效地評(píng)估基因組大小、GC含量、雜合度高低以及重復(fù)序列含量等信息，是全面了解某一物種基因組特征的有效方法；此外，通過基因組調(diào)研分析也可對(duì)基因組進(jìn)行初步組裝。
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- 群體進(jìn)化
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  針對(duì)某一物種的種內(nèi)或亞種進(jìn)行全基因組重測序或簡化基因組測序獲得基因組信息，通過與參考基因組比對(duì)，得到大量高準(zhǔn)確性的SNP、InDel、SV等變異信息，討論群體的遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳平衡和影響平衡的因素，從而從分子層面揭示該物種的進(jìn)化機(jī)制、環(huán)境適應(yīng)性等系列問題。
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- 全基因組甲基化測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  全基因組DNA甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測序平臺(tái)相結(jié)合，對(duì)有參考基因組的物種在全基因組水平進(jìn)行高精準(zhǔn)甲基化研究。WGBS可以實(shí)現(xiàn)單堿基分辨率的甲基化位點(diǎn)精準(zhǔn)、高效定位。
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- Hi-C測序
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  Hi-C技術(shù)是染色體構(gòu)象捕獲（Chromosome conformation capture，簡稱為3C）的一種衍生技術(shù)，是指基于高通量進(jìn)行染色體構(gòu)象的捕獲，結(jié)合生物信息學(xué)分析方法，研究全基因組范圍內(nèi)整個(gè)染色質(zhì)DNA 在空間位置上的關(guān)系，構(gòu)建染色體跨度單體型，同時(shí)捕獲不同基因座位上之間的空間交互信息，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息，并能開發(fā)調(diào)控基因的DNA元件。
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功能基因定位
- BSA性狀定位
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  針對(duì)研究的目標(biāo)性狀，選擇表型極端差異的親本構(gòu)建遺傳群體或家系。利用混池分組分析法（Bulk Segregant Analysis-BSA），對(duì)該家系目標(biāo)性狀表型極端的子代分別混合成的兩個(gè)樣本混池進(jìn)行測序，同時(shí)對(duì)親本進(jìn)行測序，檢測與性狀相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)并注釋，研究基因控制目標(biāo)性狀的機(jī)制。
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- 變異檢測
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  利用全基因組重測序或簡化測序技術(shù)對(duì)某一物種個(gè)體或群體的基因組進(jìn)行測序及差異分析，可獲得SNP、InDel、SV、CNV等大量的遺傳多態(tài)性信息，建立遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)庫，為后續(xù)揭示進(jìn)化關(guān)系、功能基因挖掘等奠定基礎(chǔ)。
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- 遺傳圖譜
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  基于全基因組重測序或簡化測序技術(shù)對(duì)已有參考基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的進(jìn)行測序，利用高性能計(jì)算平臺(tái)和生物信息學(xué)方法，檢測單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)（SNP），并計(jì)算多態(tài)性標(biāo)記間的遺傳連鎖距離，繪制高密度的遺傳圖譜。通過與表型性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，利用獲得的強(qiáng)關(guān)聯(lián)性標(biāo)記進(jìn)行下游基因的精細(xì)定位，從而進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析及重要性狀候選基因預(yù)測，對(duì)該物種的分子育種研究具有重大的指導(dǎo)意義。
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- 全基因組關(guān)聯(lián)分析
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-28
  對(duì)某一物種群體進(jìn)行全基因組重測序或簡化基因組測序，檢測分布于全基因組范圍內(nèi)的SNP標(biāo)記，基于它們與分析性狀的連鎖不平衡關(guān)系，通過各種統(tǒng)計(jì)分析方法，獲得與這些性狀關(guān)聯(lián)的候選基因或基因組區(qū)域。
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蛋白組學(xué)
- 標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組(iTRAQ和TMT)
  發(fā)布時(shí)間：2016-11-04
  iTRAQ是一組能標(biāo)記多肽N末端和賴氨酸側(cè)鏈氨基的同位素試劑。在二級(jí)質(zhì)譜前，每種iTRAQ標(biāo)記的同一蛋白質(zhì)表現(xiàn)為相同的理化性質(zhì)和質(zhì)荷比，保證了樣本間的實(shí)驗(yàn)均一性。而在二級(jí)質(zhì)譜中，不同樣本來源的信號(hào)離子表現(xiàn)為不同質(zhì)荷比(113-119，121)的峰，因此可以根據(jù)波峰的高度及面積，分析出不同處理的蛋白定量信息。
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建庫服務(wù)
- 建庫測序服務(wù)
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  建庫測序是運(yùn)用illumina測序平臺(tái)對(duì)客戶提供的合格文庫直接進(jìn)行測序，或者對(duì)客戶提供的合格樣品進(jìn)行建庫并測序，產(chǎn)出高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)提供給客戶進(jìn)行生物信息學(xué)分析。生物信息學(xué)分析平臺(tái)的構(gòu)建，對(duì)分子生物信息數(shù)據(jù)能夠快速獲取；滿足各種生物信息學(xué)分析所需的大規(guī)模計(jì)算能力；從互聯(lián)網(wǎng)快速接入服務(wù)器并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。提供了集軟件、硬件、數(shù)據(jù)庫于一體的強(qiáng)大的生物信息分析平臺(tái)。
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常規(guī)分子實(shí)驗(yàn)
- 轉(zhuǎn)基因服務(wù)
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-30
  客戶提供構(gòu)建好的轉(zhuǎn)化載體，或告知目的基因信息和PCR克隆模板材料，或提供相應(yīng)植物材料；默認(rèn)采用pCAMBIA2301植物表達(dá)載體轉(zhuǎn)化雙子葉植物（35S啟動(dòng)子，GUS和卡那霉素抗性篩選標(biāo)記），客戶對(duì)于載體、啟動(dòng)子和篩選標(biāo)記有指定要求的，可以雙方事先協(xié)商；擬南芥轉(zhuǎn)化株系默認(rèn)哥倫比亞野生型或Landsberg，煙草轉(zhuǎn)化株系默認(rèn)本氏煙草或NC89，番茄轉(zhuǎn)化株系默認(rèn)micro-Tom.....
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- 其他分子生物實(shí)驗(yàn)
  發(fā)布時(shí)間：2016-11-07
  采用CRISPR/Cas9技術(shù)對(duì)植物基因組進(jìn)行編輯，可針對(duì)基因組任何位點(diǎn)進(jìn)行敲除。特異性基因識(shí)別、高效的基因敲除、設(shè)計(jì)簡單快速，費(fèi)用低、客戶需提供材料、基因登錄號(hào)或ORF序列；采用煙草、擬南芥原生質(zhì)體進(jìn)行亞細(xì)胞定位，結(jié)果更加可靠。
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基因編輯
植物遺傳轉(zhuǎn)化
課題設(shè)計(jì)

市場與活動(dòng)

案例分享
進(jìn)展和動(dòng)態(tài)
- 三代測序
  發(fā)布時(shí)間：2013-11-29
  革命性的第三代測序 ---全長轉(zhuǎn)錄組，微生物基因組，基因組de novo 第三代基因測序技術(shù)又被為 “Single Molecule Real Time (SMRTTM) DNA Sequencing”(單分子實(shí)時(shí)DNA測序技術(shù))，該方法基于納米孔的單分子讀取技術(shù)，不需要擴(kuò)增即可快速讀取序列。目前，Pacific Biosciences 公司已經(jīng)成功推出了商業(yè)化的第三代測序儀PacBio RS平臺(tái)，使得第三代測序正式走入人們的視角。技術(shù)優(yōu)勢： ? 更長的測序讀長 (平均讀長可超過10000 bp，有超過50%的讀長大于14000 bp)，可大幅提高定位準(zhǔn)確性及拼接效率，有利于闡釋基因組所發(fā)生的變異以及大尺度結(jié)構(gòu)重排等信息并發(fā)現(xiàn)其相關(guān)的生物學(xué)意義。? 單分子實(shí)時(shí)檢測，模板制備時(shí)無需PCR擴(kuò)增，每一條模板鏈都可獲得相應(yīng)序列信息，數(shù)據(jù)覆蓋均勻，準(zhǔn)確；可以檢測稀有變異；? 可同時(shí)獲得動(dòng)力學(xué)信息，可進(jìn)行甲基化等修飾堿基的直接測定；? 覆蓋深度幾乎不受序列中GC/AT含量差異的影響；? 從樣本制備到獲取序列信息簡便快捷；參考文獻(xiàn)Donald S, Hagen T, Fabian G, et al. A single-molecule long-read survey of the human transcriptome [J]. Nature biotechnology, 2013.Flusberg B A, Webster D R, Lee J H, , et al. Direct detection of DNA methylation during single-molecule,real-time sequencing [J]. Nat Method, 2010.Chin C...
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- 已完成動(dòng)植物基因組測序
  發(fā)布時(shí)間：2013-11-29
  中文名拉丁名發(fā)表時(shí)間刊物科、屬基因組大小擬南芥Arabidopsis thaliana2000.12Nature十字花科、鼠耳芥屬125M水稻Oryza sativa. ssp. indica2002.04Science禾本科、稻屬466M水稻Oryza sativa. ssp. japonica2002.04Science禾本科、稻屬466M楊樹Populus trichocarpa2006.09Science楊柳科、楊屬480M葡萄Vitis vinifera2007.09Nature葡萄科、葡萄屬490M衣藻Chlamydomonas reinhardtii2007.01Science衣藻科、衣藻屬130 M小立碗蘚Physcomitrella pattens2008.01Science葫蘆蘚科、小立碗蘚屬480M番木瓜Carica papaya2008.04Nature番木瓜科、番木瓜屬370M百脈根Lotus japonicus2008.05DNA Res.豆科472 Mb三角褐指藻Phaeodactylum tricornutum2008.11Nature褐指藻屬27.4M高粱Sorghum bicolor2009.01Nature禾本科、高粱屬730M玉米Zea mays ssp. mays2009.11Science禾本科、玉米屬2300M黃瓜Cucumis sativus2009.11Nature Genetics葫蘆科、黃瓜屬350M大豆Glycine max2010.01Nature豆科、大豆屬1100M二穗短柄草Brachypodium distachyon2010.02Nature禾本科、短柄草屬260M褐藻Ectocarpus2010.06Nature水云屬 196...
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科研平臺(tái)
- 實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-26
  一流分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室博瑞德生物科技引進(jìn)多名國內(nèi)外知名高校博碩士專業(yè)人才，組建了一支分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、病理學(xué)及生物信息等多學(xué)科背景的專業(yè)團(tuán)隊(duì)。這些完備的測序平臺(tái)和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，可以提供上游測序服務(wù)和下游基因功能驗(yàn)證服務(wù)，實(shí)現(xiàn)上下游實(shí)驗(yàn)無縫銜接。專業(yè)實(shí)驗(yàn)人員實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)由專業(yè)的實(shí)驗(yàn)研究人員組成，嚴(yán)格遵循ISO15189質(zhì)量體系的要求建設(shè)，經(jīng)過大量項(xiàng)目積累，公司形成了嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)操作流程。
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- 測序平臺(tái)
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  Illumina測序儀原理Illumina新一代測序技術(shù)可以高通量、并行對(duì)核酸片段進(jìn)行深度測序，測序的技術(shù)原理是采用可逆性末端邊合成邊測序反應(yīng)，首先在DNA片段兩端加上序列已知的通用接頭構(gòu)建文庫，文庫加載到測序芯片F(xiàn)lowcell上，文庫兩端的已知序列與Flowcell基底上的Oligo序列互補(bǔ)，每條文庫片段都經(jīng)過橋式PCR擴(kuò)增形成一個(gè)簇，測序時(shí)采用邊合成邊測序反應(yīng)，即在堿基延伸過程中，每個(gè)循環(huán)反應(yīng)只能延伸一個(gè)正確互補(bǔ)的堿基，根據(jù)四種不同的熒光信號(hào)確認(rèn)堿基種類，保證最終的核酸序列質(zhì)量，經(jīng)過多個(gè)循環(huán)后，完整讀取核酸序列。利用該技術(shù)，可以對(duì)任何物種（包括動(dòng)物、植物、細(xì)菌、病毒、寄生蟲等）在DNA水平上進(jìn)行全基因組測序、基因組靶向區(qū)域測序，檢測基因組范圍內(nèi)的遺傳變異或多態(tài)性，在細(xì)菌、病毒等病原溯源上分辨率最高；在RNA水平上進(jìn)行基因的表達(dá)測序分析，準(zhǔn)確檢測基因表達(dá)量和表達(dá)片段的序列信息；對(duì)DNA處理后，可以對(duì)基因組甲基化水平進(jìn)行檢測，從表觀遺傳學(xué)角度對(duì)影響基因表達(dá)的因素進(jìn)行分析；利用轉(zhuǎn)錄因子的抗體對(duì)DNA進(jìn)行處理，尋找轉(zhuǎn)錄因子影響的DNA序列信息，定位影響基因表達(dá)的片段；自然界存在的微生物基本上都是混合物，傳統(tǒng)的Sanger法測序技術(shù)無法對(duì)混合物中的各微生物進(jìn)行準(zhǔn)確檢測，利用新一代測序的高通量、并行性特點(diǎn)，通過宏基因組分析方法，可以從整體上對(duì)自然界本來狀態(tài)進(jìn)行分析，得到最客觀信息。 Hiseq 2500系統(tǒng)HiSeq 2500系統(tǒng)是Illumina第一臺(tái)特有兩種運(yùn)行模式的測序系統(tǒng)，包括快速和高通量兩種模式，可使用一個(gè)或兩個(gè)flowcells，具有很強(qiáng)的靈活和可擴(kuò)展性。使用HiSeq v2試劑進(jìn)行快速運(yùn)行模式，可將讀長提高到2x250 bp，快速模式提供更加快速的結(jié)果、數(shù)量有限樣品的高效處理，以及更長的末端配對(duì)讀取，這...
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- 信息平臺(tái)
  發(fā)布時(shí)間：2016-10-27
  超大計(jì)算集群
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發(fā)表文章
技術(shù)資料

師資隊(duì)伍
- 榮譽(yù)高級(jí)教師--（ADAWONG）
  發(fā)布時(shí)間：2014-10-28
  ·本科及本科以上學(xué)歷·英語為母語(來自美國，英國，加拿大，澳洲，新西蘭）·有教學(xué)經(jīng)驗(yàn)及商務(wù)背景·外籍專家證 Foreign Expert Certificate·有國際認(rèn)可教師資格證知名師范院校外語系師范專業(yè)畢業(yè)，畢業(yè)以來就一直從事小學(xué)、初中的教學(xué)和研究工作，6年的任教經(jīng)驗(yàn)，特別是一年國際學(xué)校任教的經(jīng)歷，讓我對(duì)中、外的小學(xué)生的語言學(xué)習(xí)有了更多的認(rèn)識(shí)；在我的課堂中，學(xué)生的興趣始終是我關(guān)注的出發(fā)點(diǎn)；另外，語言不僅是一門語言，同時(shí)也是一種文化；更難得是的思維習(xí)慣的養(yǎng)成；我喜歡活躍互動(dòng)的課堂形式，有趣的課堂形式利于提高學(xué)生的學(xué)習(xí)積極性，同時(shí)我也很喜歡教授學(xué)生掌握解題的關(guān)鍵，各類口訣梳理語法重難點(diǎn)是掌握的捷徑！
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- 榮譽(yù)高級(jí)教師--（LINDA）
  發(fā)布時(shí)間：2014-10-28
  ·本科及本科以上學(xué)歷·英語為母語(來自美國，英國，加拿大，澳洲，新西蘭）·有教學(xué)經(jīng)驗(yàn)及商務(wù)背景·外籍專家證 Foreign Expert Certificate·有國際認(rèn)可教師資格證 Hello，我是LINDA，畢業(yè)于廣州著名學(xué)府的英語教育專業(yè)，擅長地道的口語教學(xué)，多年的口語教學(xué)經(jīng)驗(yàn)告訴我，口語學(xué)習(xí)必須要大膽開口說，英語是一種語言，重要的是懂得如何交流和溝通。流利的口語更可以提高語感，有助于更容易學(xué)習(xí)英語。我喜歡活躍互動(dòng)的課堂形式，有趣的課堂形式利于提高學(xué)生的學(xué)習(xí)積極性，幫助你找到適合自己的英語學(xué)習(xí)方法、掌握解題的關(guān)鍵，獨(dú)特而有個(gè)性的教學(xué)風(fēng)格是我的課堂。
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- 榮譽(yù)高級(jí)教師--（Sammi）
  發(fā)布時(shí)間：2014-10-28
  ·本科及本科以上學(xué)歷·英語為母語(來自美國，英國，加拿大，澳洲，新西蘭）·有教學(xué)經(jīng)驗(yàn)及商務(wù)背景·外籍專家證 Foreign Expert Certificate·有國際認(rèn)可教師資格證最受學(xué)生歡迎的英語女神。教學(xué)成績：2013年獲評(píng)明師教育最受學(xué)生喜愛女教師金獎(jiǎng)； 2014年班均人數(shù)、帶班量居英語科頭名，并創(chuàng)下英語科目班均人數(shù)最多紀(jì)錄；曾參加高考口語，一?？谡Z評(píng)卷工作，英語口語界權(quán)威代表。教學(xué)特點(diǎn)：10年豐富的教學(xué)經(jīng)驗(yàn)，執(zhí)教高三保證班超過6年。自創(chuàng)語法填空（Grammar）穩(wěn)奪8空技巧，小作文首句法，20分鐘高分大作文速成法，助你挑戰(zhàn)速度極限。2013年以來Sammi所帶的班期期爆棚，人數(shù)居高不下，被學(xué)生奉為英語女神。
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- 榮譽(yù)高級(jí)導(dǎo)師--（Pow）
  發(fā)布時(shí)間：2014-10-28
  ·本科及本科以上學(xué)歷·英語為母語(來自美國，英國，加拿大，澳洲，新西蘭）·有教學(xué)經(jīng)驗(yàn)及商務(wù)背景·外籍專家證 Foreign Expert Certificate·有國際認(rèn)可教師資格證擁有全國認(rèn)可的英語專業(yè)最高等級(jí)證書---TEM-8,極具英語權(quán)威?？炭嚆@研Task-based Language Teaching(TBLT)教學(xué)法，熟練掌握Reading, Speaking, Listening, Writing課堂教學(xué)技能，在教壇憑借新穎教學(xué)方法，獲得家長和學(xué)生一致好評(píng)，獲得“最佳教師獎(jiǎng)”。 “3P”魅力(Professional, Passionate, Patient)專業(yè)+熱情+耐心=100% 魅力 Rachel執(zhí)教的英語課堂生動(dòng)有趣
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- 榮譽(yù)高級(jí)導(dǎo)師--（Sarah）
  發(fā)布時(shí)間：2014-10-28
  ·本科及本科以上學(xué)歷·英語為母語(來自美國，英國，加拿大，澳洲，新西蘭）·有教學(xué)經(jīng)驗(yàn)及商務(wù)背景·外籍專家證 Foreign Expert Certificate·有國際認(rèn)可教師資格證經(jīng)驗(yàn)豐富·考點(diǎn)明確：Sarah具有豐富的教學(xué)經(jīng)驗(yàn)，長期擔(dān)任明師初中英語教材組成員，負(fù)責(zé)各大名校試卷分析工作，熟知初中各年級(jí)英語考點(diǎn)，提煉各類“易錯(cuò)題”、“高頻題”;善于歸納解題方法和構(gòu)建、整理知識(shí)結(jié)構(gòu)體系;同時(shí)擅長針對(duì)考試題型演示解題方法，炮制最適合學(xué)生的“搶分秘笈”。幽默課堂·輕松學(xué)習(xí)：Sarah以獨(dú)特的“棟篤笑”風(fēng)格，打造具有個(gè)人特色的幽默課堂，為學(xué)生們提供輕松、愉悅的學(xué)習(xí)環(huán)境。對(duì)于初中英語較難的知識(shí)點(diǎn)，Sarah善于以生動(dòng)有趣的例子詮釋，加速學(xué)生的理解及記憶。
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發(fā)表文章
技術(shù)資料
- 2015-PNAS-扁形蟲基因組測序
  發(fā)布時(shí)間：2013-12-02
  The free-living flatworm, Macrostomum lignano has an impressive regenerative capacity. Following injury, it can regenerate almost an entirely new organism because of the presence of an abundant somatic stem cell population, the neoblasts. This set of unique properties makes many flatworms attractive...
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- A hybrid approach for de novo human genome sequence assembly and phasing
  發(fā)布時(shí)間：2013-12-02
  An overview of our assembly strategy is shown in Figure 1. We started with a SOAPdenovo- based de novo assembly of Illumina sequence data from human HapMap sample NA12878, which had a contig N50 of 11.1 kb and a scaffold N50 of 590 kb after filtering for scaffolds that were at least 3 kb in length (...
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- 菠蘿基因組三代測序
  發(fā)布時(shí)間：2013-12-02
  Transposable elements and expression of retrotransposons Long terminal repeat (LTR) retrotransposons were identified using structural criteria10,11. About 44% of the assembly was accounted for by TEs (Supplementary Table 8 ). LTR retrotransposons were the most abundant of these elements, repres...
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- 蘋果基因組測序journal.pone.0149934
  發(fā)布時(shí)間：2013-12-02
  Winter dormancy is a well known mechanism adopted by temperate plants, to mitigate the chilling temperature of winters. However, acquisition of sufficient chilling during winter dor-mancy ensures the normal phenological traits in subsequent growing period. Thus, low tem-perature appears to play cruc...
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- Genome and Transcriptome Sequences Reveal the Specific Parasitism of the Nematophagous Purpureocilli
  發(fā)布時(shí)間：2013-11-28
  Whole genome protein families were classified by InterProScan analysis (Jones et al., 2014). The peptidase families were identified by BLASTP searching against MEROPS peptidase database release 9.12 with a cuto? e-value of 1e-20 (Rawlings et al., 2014). The transporters were classified on the b...
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